可以直觀的看到粒子的形態(tài)，因此可以用于鑒定外泌體的存在和完整性，但是包括支原體、鐵蛋白聚團(tuán)、聚乙二醇蛋白聚團(tuán)、溶酶體等的電鏡圖片與外泌體都十分相似，并且電鏡只能展示局部景象。因此，電鏡成像無法區(qū)分外泌體及形態(tài)相近的納米粒子，且不能反映樣品中的外泌體數(shù)量。

是一種測算粒子群體直徑分布和粒子數(shù)量的計算方法，它通過光學(xué)原理感知粒子的存在，因此可以確認(rèn)外泌體樣品中的“外泌體"數(shù)量和直徑的群體特征，但是無法確認(rèn)檢測到的粒子是否為外泌體，不能反映粒子形態(tài)，無法將外泌體和其他納米粒子區(qū)分開。因此NTA不能確認(rèn)外泌體的真實存在和外泌體的完整性。

可以鑒定外泌體中存在的特定蛋白，WB檢測外泌體標(biāo)志蛋白可以說明外泌體成分的存在。但是目前的這些標(biāo)志物蛋白只是會在外泌體里富集，而并不是外泌體所有的，諸如CD63、ALIX等在細(xì)胞中都有，在一些細(xì)胞碎片、溶酶體、胞內(nèi)體中也大量存在。因此，WB僅能證實外泌體成分的存在，無法確認(rèn)外泌體的數(shù)量和完整性。